piątek, 27 grudnia 2013

Test przyłóżkowy (POCT) do wykrywania antygenu kryptokokowego w PMR

Test kasetkowy do stosowania przy łóżku choreg (POCT) do wykrywania w próbkach płynu mózgowego kryptokokowego antygenu otoczkowego - glukuronoksylomannanu (określanego w skrócie - CRAG) (wykorzystuje połączone ze złotem monoklonalne przeciwciała impregnowane na pasku do rozdziału chromatograficznego. Test wykrywa antygeny wszystkich serotypów (A-D).
Serotyp A - Cr.  neoformans var. grubbii teleomorfa Filobasidiella neoformans Serotyp B - Cr. gatti - teleomorfa Filobasidiella bacillisporaSerotyp C - Cr. gatti - teleomorfa Filobasidiella bacillisporaSerotyp D - Cr. neoformans var. neoformans  teleomorfa Filobasidiella neoformans
Gdy w badanej próbce obecny jest antygen przeciwciała skoniugowane ze złotem wiążą go. Kompleks Au-Ab-CrAg migruje dzięki siłom kapilarnymi wzdłuż paska testowego i łączy się z przytwierdzonymi w określonym miejscu monoklonalnymi przeciwciałami przeciw CrAg (tworzy czerwoną linię - wynik dodatni), a przeciwciała w linii kontrolnej testu wyłapują niezwiązane AuAbs. 



Rysunek. Zasada działania testu paskowego





Do reakcji wykorzystuje się kroplę rozcieńczalnika (ok. 40 μl) i kroplę próbki (płynu mózgowo-rdzeniowego lub surowicy -ok. 40 μl). Pasek umieszcza się w specjalnym pojemniku i inkubuje w temp. pokojowej przez 10 min. Test może być przechowywany w temp. pokojowej do 2 lat. 



Filmik ze strony producenta\



Ostatnio opublikowano na stronach CDC artykuł na temat przydatności testu wykrywania antygenu kryptokokowego w płynie mózgowym, w którym określano czułość i swoistość tego testu.

Badacze przepadali próbki od 832 pacjentów zakażonych HIV z podejrzeniem kryptokokowego zapalenia opn mózgowo rdzeniowych w Ugandzie (2006-2009) i 533 w Ugandzie i RPA (2010-2012).
CRyptococcalAntiGen-LateralFlowAssay  cechował się czułością 99,3% i swoistością 99,1%. W badaniach ponadto zastosowano technikę hodowlanę, która w zależności od objętości próbki PMR miała dla 10 μl czułość 82,4% i dla 100 μl 94,2 %. Testy aglutynacji lateksowej antygenu kryptokokowego parametry zależały od producenta i czułość 97-97,8%, a swoistość od 85,9 - 100 %. PReparat bezpośredni w tuszu chińskim (nigrozynie) wykazał czułość 86%. (http://wwwnc.cdc.gov/eid/article/20/1/13-0906_article.htm)

Strona producenta testu
http://www.immy.com/products/cryptococcal-antigen-lateral-flow-assay-lfa/




wtorek, 10 grudnia 2013

Mięsożerne grzyby


Rysunek pochodzi stąd http://www.microecos.com/?p=255

Jest tam też parę linków:

Rodzaje pułapek -> http://www.biological-research.com/philip-jacobs%20BRIC/fangorg.htm


a wszystko za sprawą artykułu w Science dotyczącego mięsożernych grzybów z bursztynu z okresu kredowego...

Carnivorous Fungi from Cretaceous Amber

Carnivorous fungi dating back to the age of the dinosaurs have been found fossilized in circa-100-million-year-old amber. The fossil fungi used hyphal rings as trapping devices and are preserved together with their prey, small nematodes. The excellent preservation in amber allowed comparison with extant groups: On the basis of the mode of ring formation and the dimorphic mode of life, the fossils cannot be assigned to any recent carnivorous fungus, providing evidence that different groups occupied this ecological niche in the Cretaceous and that trapping devices were developed independently multiple times in the course of Earth history.

wtorek, 9 lipca 2013

Mikafungina dopuszczona w leczeniu niemowląt

Amerykańska FDA dopuściła do stosowania u pacjentów od 4 miesiąca życia mikafunginę - lek z grupy echinokandyn.

Mikafungina (Mycamine, Astellas) stosowana jest w postaci wlewów dożylnych w leczeniu pacjentów w wieku od 4 miesięcy z kandydemią, ostrą rozsianą kandydozą, zapaleniem otrzewnej o etiologi Candida u pacjentów w czasie przeszczepu komórek krwiotwórczych.

Bezpieczeństwo tego leku zostało ocenione na 479 pacjentach w wieku od 3 dni do 16 roku życia, którzy otrzymali co najmniej jedną dawkę mikafunginy w 11 różncyh badaniach klinicznych. Średni czas terapii wynosił 24,8 dnia. We wszystkich badaniach pediatrycznych 92% pacjentów (439 na 479) miało objawy niepożądane związane z leczeniem. Najczęstszymi były: wymioty (31%), biegunka (22%), gorączka (22%), nudności (19%), ból brzucha (16%) i  trombocytopenia (15%)


 Źródło: Healio.com

czwartek, 27 czerwca 2013

Częstość wystepowania grzybic człowieka

Oportunistyczne grzybice inwazyjne:

  • aspergiloza (Aspergillus fumiagtus) - szacunkowa chorobowość w populacji światowej >200 tys.; śmiertelność 30-95%
  • kandydoza (Candida albicans) - szacunkowa chorobowość w populacji światowej >400 tys.; śmiertelność 46-75%
  • kryptokokoza (Cryptococcus neoformans) - szacunkowa chorobowość w populacji światowej > 1mln; śmiertelność 20-70%
  • mukormykoza (Rhizopus oryzae) - szacunkowa chorobowość w populacji światowej > 10 tys.; śmiertelność 30-90%
  • pneumocystoza (Pneumocystis jirovecii )szacunkowa chorobowość w populacji światowe >400 tys.; śmiertelność 20-80%
Grzybice endemiczne (tropikalne)
  • blastomykoza (Blsatomyces immitis) – występowanie: środkowo zachodnie i nadantlantyckie stany USA; chorobowość ~3000;  śmiertelność <2-68%
  • kokcydioidomykoza (Coccidioides immitis) – występowanie: południowo-zachodnie USA; chorobowość ~25000; śmiertelność <1-70%
  • histoplazmoza (Histoplasma capsulatum) - występowanie: środkowo-zachodnie USA; chorobowość ~25000; śmiertelność 28-50%
  • parakokcydioidomykoza (Paracoccidioides brasilliensis); występowanie: Brzaylia; chorobowość ~4000; śmiertelność 5-27%
  • penicylioza (Penicllium marneffei); występowanie – południowo-wschodnia Azja; chrobowość >8000 śmiertelność 2-75%
Źródło: G. D. Brown, D. W. Denning, N. A. R. Gow, S. M. Levitz, M. G. Netea, T. C. White, Hidden killers: Human fungal infections. Sci. Transl. Med. 4, 165rv13 (2012).

sobota, 25 maja 2013

Dermatofity w skaningowym mikroskopie elektronowym

Czasami miło się oderwać od płaskości, dwuwymiarowych obrazów mikroskopu świetlnego i błękitu laktofenolu. Poniżej zdjęcia znalezione na sciencephoto



Trichophyton rubrum




Epidermophyton floccosum


Microsporum gypseum



Microsporum canis




Trichophyton mentagrophytes


Microsporum persicolor

wtorek, 23 kwietnia 2013

Wojny drożdżowe


Znalezione w pewnej prezentacji (niestety bez podpisu autora).


Tłumaczenie: Znowu wojna wybuchła na środkowym drożdżu (gra słowna współbrzmienie "yeast" - drożdże z "east" - wschód).

środa, 27 lutego 2013

Strzępki (ciałka) guzkowate (węzłowate; nodular bodies hyphae)


Strzępki guzkowate, (węzłowate, ang. nodular bodies, nodular hyphae) to elementy grzybni charakterystyczne dla niektórych dermatofitów m. in. Trichophyton interdigitale. Na poniższych zdjęciach przedstawione są przykładowe ciałka guzkowate w powiększeniu obiektywu x100. Poniżej ilustracja z Atlasu de Hooga przedstawiająca strzępki T. interdigitale - rysunek b pokazuje strzępki guzkowate.


Trichophyton interdigitale, a. CBS 343.79; b, c. CBS 565.94. a. Microconidia; b. nodular bodies in aerial mycelium; c. pigment-exuding hyphae. 
źródło rysunku: Hoog, G.S. de. 2000. Atlas of clinical fungi dostępne MycoBank

piątek, 25 stycznia 2013

Asp ICU 2

AspICU2 to wieloośrodkowe oparte na sieci Internet badania w celu określenia
obciążenia zakażeniami Aspergillus u ciężko chorych pacjentów.


więcej informacji w Short protocol
zgłoszenie uczestnictwa http://www.aspicu2.org/registration.asp?act=new

czwartek, 27 grudnia 2012

Miedzynarodowa Sieć Zakażeń Grzybiczych w Pediatrii

Oddział Pediatryczny Szkoły Medycznej Uniwersytetu Duke w Durham (Karolina Północna) powołał wieloośrodkową międzynarodową sieć  w celu poznania inwazyjnych zakażeń grzybiczych u dzieci celu zapobiegania i poprawy opieki zakażonych pacjentów.




Więcej: http://pediatrics.duke.edu/research/initiatives/pediatric-fungal-network

Światowy Rejestr Rzadkich Zakażeń Grzybiczych - Fungiscope



FUNGISCOPE to istniejący od 2010 r resjestr gromadzący dane dotyczące przypadków zakażeń rzadkimi grzybami strzępkowymi, szczególnie fuzariozy (Fusarium spp.) i zakażeń innymi grzybami m. in. Scedosporium spp., Penicillium spp., Acremonium spp., Paecilomyces spp., Trichoderma spp. oraz grzybami ciemnopigmentowymi Alternaria spp., Aureobasidium spp., Bipolaris spp., Cladophialophora spp., Cladosporium spp., Curvularia spp., Exophiala spp., Philophora spp., oraz rzadkimi drożdżami np. Trichosporon spp.

Kryteriami włączenia są:
- dowody hodowlane, histopatologiczne, antygenowe lub DNA potwierdzające inwazyjene zakażenie
Kryteria wyłączenia:
 - zakażenia wywołane przez Aspergillus spp., Candida spp., Cryptococcus neoformans, Pneumocystis jiroveci, Zygomycetes*
- zakażenia endemiczne np. kokcydioidomykoza, histoplazmoza
- kolonizacja i inne nie inwazyjne zakażenia

Za wypełnienie wpisu przewidziana jest rekompensata finansowa 100 € za każdy wpis, ponadto za uostępnienie izolatu przewidziano dodatkowo 50 €.
Ponadto z zebranych danych zostaną przygotowane publikacje (istnieje możliwość współautrstwa).


Więcej na stronie  http://www.fungiscope.net/

*W przypadku chęci zgłoszenia zakażenia grzybami z grupy Zygomycetes istnieje grupa badwacza z ramienia ISHAM (ISHAM/ECMM Zygomycosis Study Group)

 

niedziela, 16 grudnia 2012

Scopulariopsis brevicaulis

Kingdom: Fungi
Phylum: Ascomycota
Class: Euascomycetes
Order: Microascales
Family: Microascaceae
Genus: Scopulariopsis


Gatunek o szerokim zasięgu występowania. Izolowany często z gleby. U człowieka może powodować pleśnicę paznokci, w tym akauliozę (grzybicę palucha).
Zdjęcie z mikroskopu świetlnego przedstawiające charakterystyczny dla Scopulariopsis układ zarodników



Kolonie Scopulariopsis na podłożu Sabourauda po tyg. hodowli

Kropidlak czarny

Gatunek szeroko rozpowszechniony na świecie, często izolowany z gleby. Jest powszechnym zanieczyszczeniem żywności powodując jej pleśnienie (czarna pleśń) Może być przyczyną otomykozy - "ucho pływaka" (infekcja grzybicza ucha). Wdychana duża ilość zarodników może powodować choroby płuc - klątwa Tutenhamona.
Dyskusyjna jest produkcja przez szczepy tego gatunku ochratoksyny, która jak inne mykotoksyny jest niebezpieczna dla człowieka (tak jak znana aflatoksyna).

A. niger jest wykorzystywany w przemyśle do produkcji kwasu cytrynowego i glukonowego. Produkuje on także wiele enzymów m. in glukoamylazę i peptynazę.








W mikroskopie widoczne konidiofory o różnej wielkości, o ścianach trzonka gładkich, bezbarwne lub czasem brązowawe. Trzonki pod szczytem przechodzą w rozdętą buławkę (vesicle) , której średnica może dochodzić do 100 mikrometrów.





Uzupełnienie:
Wiki Info
MycologyONLINE
school mold

czwartek, 25 października 2012

Migawki z życia plesni

Fusarium - film

W serwisie YouTube został udostępniony rewelacyjny film o Fusarium.
Oprócz biologii grzybów z rodzaju Fusarium w filmie mozna zapoznać się z podstawowymi pojęciami dotyczacymi grzybów: chlamidospory, peritecja, sporodochia, makrokonidia.

czwartek, 23 sierpnia 2012

Nowa storna internetowa - Invasive Fungal Infection Forum

Otwarta została witryna interntowa dotycząca grzybic inwazyjnych w subsaharyjskiej Afryce.Na stronie głównej przedstawione są cele powstania strony, które przytaczam w wolnym tłumaczeniu:

Założeniem tej strony jest stworzenie forum, gdzie lekarze, laboranci, naukowcy, pielęgniarki i wszyscy zainteresowani tematem leczenia pacjentów w szczególności pacjentów z immunosupresją mogą podzielić się swoją wiedzą i doświadczeniem. Ma na celu dostarczyć wiedzę na temat współczesnych trendów w diagnostyce i leczeniu. Ma na celu również dostarczenie odwołań do innych specjalistów w tej dziedzinie, dostarczyć możliwośi współpracy, które mogłyby pomóc w opracowaniu wytycznych i protokołów dotyczących obchodzenia się z tgo typu pacjentami.

Znajdą się na niej również ogłoszenia o konferencjach, warsztatatch, informacje o możlowści szkoleń, jak również o grantach i stypendiach.

Strona chce wieść prym w dostarczaniu informacji i materiałów o inwazyjnych grzybicach w Afryce subsaharyjskiej.

Jest tam wiele zakładek, wśród których już można odnaleźć pierwsze materiały. Zobaczcie i oceńcie sami klikając w ten link IFIF

wtorek, 31 lipca 2012

Preparat w błękicie anilinowym w roztworze laktofenolu i mikrohodowla szkiełkowa



 

Kilka uwag BHP do powyższego filmiku:
  • opalanie szkiełka powinno się wykonywać z użyciem pęsety
  • z materiałem zakaźnym lub potencjalnie zakaźnym należy pracować w rękawicach i odzierzy ochronnej 



Preparaty wykonane w sposób przedstawiony na powyższym filmie nie są zbyt dobre przy identyfikacji gatunków, dlatego należy wykonać mikrohodowlę szkiełkową. Sposób wykonania świetnie ilustruje poniższy filmik.