Ilościowa ocena tworzenia biofimu

Na łamach bieżącego numeru Medical Mycology ukazał się krótki komunikat na temat metod ilościowego określania tworzenia biofilmu Candida albicans. Bez zgłębiania się w szczegóły, poniżej została zacytowana tabela dokonującą porównania stosowanych powszechnie metod w odniesieniu do oceny tworzenia biofilmu w elektronowym mikroskopie skaningowym (SEM):

Metoda	Dokładność	Powtarzalność	Czasochłonność	Koszt
XTT	+++	++++	+	++
CV	+	++++	++	+
CFU	++	++++	+++	++
DNA	-	+++	++	+++
amplifikacja	-	++	+++	++++
białka BCA	+	+	+	+
sucha masa	-	++	++	+

Dokładność określa czy uzyskane wynik pokrywają się z obrazami uzyskanymi w SEM, jak również czy różnica między szczepami była statystycznie istotna (p<0.05). Powtarzalność określona jest współczynnikiem zmienności (CV) dla wszystkich grup danych ++++ = CV<0,1; +++ = CV 0,1-0,15; ++ = CV 0,15-0,2; + = CV >0,2. Czasochłonność odpowiada całkowitej długości trwania protokołu, a także nakładowi pracy jaki należy poświęcić dla każdego protokołu: ++++ oznacza najbardziej czasochłonny protokół badania. Koszt oparty jest na ilościach odczynników potrzebnych dla 6 dołkowych płytek, przy założeniu, że badacze posiadają dostęp do potrzebnej aparatury: ++++ = >$100 /płytka; +++ = $20-100$/płytka; ++ = 10-20$ płytka, + = <10$/płytka.

Struktura biofilmu w SEM. źródło NCBI

Źródło i szczegóły: Med Mycol. 50:214-218, 2012